遠東生技多年來，累積微藻培養經驗並與強大研發團隊共同創新，不斷發展微藻科學，在新藥、生醫、保健等領域持續獲得肯定。
關速能捷EX及攝得順榮獲「保健食品創新獎」。
遠東生技與長庚大學共同召開記者會發表對COVID 19研究報告。
順暢特工及Apogen愛保清藍晶益生菌榮獲「保健食品創新獎」。
鄧白氏運用全球最大商業數據庫的優勢，評選出全國最具出口競爭力的 TOP 1000 中小企業。2019第六屆以「打造企業高效營運」作為中心思想，肯定遠東生技各方面表現，頒發「鄧白氏中小企業菁英獎」。
Apogen愛保清健康口含錠榮獲「保健食品創新獎」。
ApoX防毒霸獲得「SNQ國家品質標章」，同年獲得「SNQ防疫類組銅獎」。
特級藍藻錠以「特殊維生素B12培養技術」，榮獲「保健食品創新獎」。
植物DHA藻油膠囊榮獲「保健食品創新獎」。
遠東生技LS-66® 孢子乳酸菌粉末榮獲「衛生福利部健康食品認證」，經動物實驗結果證實，有助於增加腸內益生菌。
除了營養保健與生醫檢測等研究開發，亦投入綠能環保領域，取得「Solargen微藻碳3D立體栽培技術」，應用於生質柴油開發及水質淨化工程，以豐沛研發能量獲頒「創新研發類 科技農企業菁創獎」。
第三屆科技展「科技應用類 企業菁創獎」入選。
遠東生技榮獲經濟部產業科技發展獎 企業獎優等。台灣生醫暨生農產業選秀 生醫組銅牌。
經濟部第17屆中小企業創新研究獎。遠東生技之發展潛力值得期待，獲頒「優等創新企業獎」。
入圍臺北市生技產業最大榮耀的「2009台北生技獎」，並以「遠東生技系列產品全球行銷模式」榮獲技術商品化獎銀牌獎。
遠東極品CV-66茯加力藻錠獲台灣保健食品學會頒贈「營養保健食品創新獎」獎項。
遠東螺旋藻榮獲94年度「國家生技醫療品質獎」，為品質卓越的象徵。
FEBICO幼兒健康素獲台灣保健食品學會頒贈「營養保健食品創新獎」獎項。
